Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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D130052B06RikQ3UW13 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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D130052B06RikQ3UW13 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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D130052B06RikQ3UW13 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
D130052B06RikQ3UW13 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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D130052B06RikQ3UW13 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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D130052B06RikQ3UW13 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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D130052B06RikQ3UW13 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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D130052B06RikQ3UW13 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
D130052B06RikQ3UW13 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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