Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nr1d1Q3UV55 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms