Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3USZ8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3USZ8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3USZ8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3USZ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3USZ8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3USZ8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3USZ8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3USZ8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3USZ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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