Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Syndig1lQ3USQ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms