Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5460Q3UQ97 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5460Q3UQ97 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5460Q3UQ97 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5460Q3UQ97 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5460Q3UQ97 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5460Q3UQ97 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm5460Q3UQ97 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5460Q3UQ97 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5460Q3UQ97 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5460Q3UQ97 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5460Q3UQ97 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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