Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms