Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Tmem253Q3UNB8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem253Q3UNB8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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