Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smu1Q3UKJ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smu1Q3UKJ7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms