Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rmdn3Q3UJU9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms