Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms