Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod2Q3UHZ5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod2Q3UHZ5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms