Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Greb1Q3UHK3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms