Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH06

Rreb1, Ras-responsive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rreb1Q3UH06 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rreb1Q3UH06 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rreb1Q3UH06 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rreb1Q3UH06 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rreb1Q3UH06 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rreb1Q3UH06 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rreb1Q3UH06 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rreb1Q3UH06 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rreb1Q3UH06 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rreb1Q3UH06 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rreb1Q3UH06 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rreb1Q3UH06 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rreb1Q3UH06 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rreb1Q3UH06 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rreb1Q3UH06 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rreb1Q3UH06 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms