Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms