Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Rnf40Q3U319 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Rnf40Q3U319 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rnf40Q3U319 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf40Q3U319 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf40Q3U319 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf40Q3U319 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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