Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pag1Q3U1F9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pag1Q3U1F9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms