Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc174Q3U155 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc174Q3U155 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms