Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mbd6Q3TY92 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms