Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms