Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3TTL0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms