Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc69Q3TCJ8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms