Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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