Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-M3Q31093 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms