Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam47cQ14BE7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms