Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms