Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Traf3ip1Q149C2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Traf3ip1Q149C2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Traf3ip1Q149C2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Traf3ip1Q149C2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Traf3ip1Q149C2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Traf3ip1Q149C2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Traf3ip1Q149C2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Traf3ip1Q149C2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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