Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Perm1Q149B8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Perm1Q149B8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Perm1Q149B8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms