Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r2Q0VGB7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms