Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd12Q0VE29 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms