Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms