Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Cntnap5cQ0V8T7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Cntnap5cQ0V8T7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cntnap5cQ0V8T7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cntnap5cQ0V8T7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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