Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps8Q0P5W1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps8Q0P5W1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms