Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spata18Q0P557 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms