Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssrp1Q08943 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms