Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnma1Q08460 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms