Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm3Q08189 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tgm3Q08189 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms