Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Siah1bQ06985 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah1bQ06985 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms