Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mex3cQ05A36 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mex3cQ05A36 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms