Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Thbs3Q05895 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs3Q05895 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs3Q05895 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms