Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Fmn1Q05860 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms