Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox12Q04890 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms