Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcr5Q04683 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms