Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Msx2Q03358 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms