Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NfiaQ02780 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NfiaQ02780 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms