Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcqQ02111 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms