Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snai1Q02085 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snai1Q02085 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms