Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbp1Q01514 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbp1Q01514 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms