Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja5Q01231 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja5Q01231 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms