Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Serpina1cQ00896 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms