Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga4Q00651 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itga4Q00651 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms